1. 기기의 감지 플럭스
가장 먼저 고려해야 할 사항은 실험실에서 정량적 PCR 장비를 사용해야하는 빈도입니다. 캘리포니아 대학교 샌프란시스코 암 센터의 게놈 분석 장비 책임자 인 David Ginzinger는 시중에 나와있는 대부분의 정량적 PCR 기계를 테스트했습니다. 예를 들어 대규모로 사용하지 않는 경우, 주로 알려진 유전자를 검사하는 데 사용되므로 고가의 고급 제품이 필요하지 않다고 말했다. 그러나 새로운 약물 표적과 질병 표지자를 찾아야하는 실험실의 경우 384 웰 플레이트를 수용하고 더 빠르게 실행할 수있는 기기가 필요합니다. 그러나 이러한 고 처리량 기기 만이 충분히 빠르지 않으며 샘플 준비가 속도 제한의 병목 현상이된다는 것을 알게 될 것입니다. 따라서 처리량이 많은 실험실에서는 종종 추가 자동화 기기가 필요합니다. 버튼을 누르면 기기가 자동으로 샘플을 처리하고 핵산을 정제하고 PCR 템플릿을 준비합니다.
2. 다중 증폭 능력
다중 증폭이 점점 뜨거워지고 있습니다. 실시간 정량 PCR 장비는 면역성이 없습니다. 고급 정량 PCR 기기에는 여러 개의 검출 채널이 있으므로 기기는 동일한 샘플 탱크에서 여러 템플릿의 증폭 과정을 감지 할 수 있습니다. 새로운 LightCycler2.0에는 원본보다 3 개 더 많은 6 개의 감지 채널이 있습니다. SmartCyclerⅡ에는 4 개의 감지 채널이 있습니다. 라이브러리 제품으로 유명한 스트라 타진은 로슈의 절반도 안되는 가격의 정량 PCR 기기 Mx3000P도 보유하고 있으며, 4 개의 검출 채널로 호평을 받고있다. 그러나 다중 증폭은 실험을 복잡하게하기 때문에 모든 사람에게 적합하지 않습니다.
3. 소프트웨어
정량적 PCR 기기를 선택할 준비가되면 첨부 된 소프트웨어를 확인해야합니다. 사용하기 편리합니까, 필요한 분석을 수행 할 수 있습니까, 여러 출력 형식이 있습니다. 그러나 너무 사용하기 쉬운 소프트웨어가 기능상 비교적 단순하고 복잡한 계산을 수행 할 수 없는지주의해야합니다. 이전 소프트웨어에서는 추가 분석을 수행해야합니다. 새로운 소프트웨어는 이미 모든 것을 처리 할 수 있습니다. 기본 기능 외에도 일부 소프트웨어는 프라이머 및 프로브 설계, 다중 분석 설계, 배경 보정, 데이터 정규화 등과 같은 더 많은 기능을 가질 수 있습니다. Roche의 응용 과학 부서의 응용 및 기술 서비스 부서장 인 Willian Demyan은 정량적 PCR이 기하학적 증폭의 과정이라고 강조했습니다. 처음에는 복사 차이가 있으며 결과는 기하학적 순서에 따라 다릅니다.
4. 유연성
대규모의 바쁜 실험실 장비는 확실히 부러워 할 만하 며 기존 실험실에서도 훌륭한 선택을 할 수 있습니다. 현재 공급 업체에는 현재 요구 사항을 이해하기 위해 많은 기술 전문가가있을뿐만 아니라 업그레이드 가능한 다양한 액세서리 및 모듈 제공과 같은 가능한 미래 수요 변화를 고려할 수 있도록 매우 사려 깊습니다. BioRad의 MyCycler는 모듈을 선택하고 실시간 정량화로 업그레이드 할 수 있습니다. ABI의 정량적 PCR 장비에는 다양한 샘플 탱크가 있으며, 96 웰 탱크를 이중 384 웰 탱크로 변경하여 일부 높은 처리량 요구 사항을 충족 할 수 있습니다. 소량으로 qPCR을 방금 시작한 실험실의 경우 SmartCycler II 정량 PCR 기기가 좋은 선택입니다. 기본 모듈에는 16 개의 독립적 인 온도 제어 샘플 탱크가 있으며 16 개의 완전히 독립적 인 다른 실험을 동시에 또는 전후에 수행 할 수 있습니다. "접속하다"; 실험실에서 대규모 실험이 필요한 경우 96 개의 샘플 웰인 1 개에서 6 개의 기본 모듈로 매우 경제적으로 업그레이드 할 수 있습니다. 96 웰 플레이트는 사용할 수 없지만 학생이 소량의 실험을 시작하면 다른 학생도 언제든지 연결하여 독립적 인 실험을 시작할 수 있으며 서로 간섭하지 않아 유연성이 증가합니다. 실험 횟수가 적고 처음에는 예산이 빠듯한 실험실에 매우 유연한 옵션입니다.
5. 불확실성
소프트웨어가 부분적으로 수정 될 수는 있지만 계산보다 많은 계산 수정을 요구하지 않고 체계적인 오류가 적은 기기를 구입하는 것이 좋습니다. Cinzinger는 기기의 샘플 웰 간의 차이에 특별한주의를 기울여야한다고 생각합니다. 샘플 구멍 사이의 잘 알려진 온도 차이 외에도 샘플 구멍과 감지 프로브 사이의 광 경로 거리에 작은 차이가 있으며 신호 송수신을 담당하는 광섬유 길이의 약간의 차이가 있습니다. , 렌즈와 샘플 구멍 사이의 거리와 각도의 작은 차이, 심지어 신호 전송에 대한 샘플 셀의 영향. Cinzinger는 대부분의 상용 정량 PCR 기기에서 동일한 테스트를 수행했습니다기기의 각 웰에서 동일한 샘플과 시약을 실시간으로 증폭합니다. 불행히도 여러 번 다른 샘플 웰간에 다른 결과가있을 것입니다.
6. 키트 선택
영업 직원은 우수한 품질 관리 키트를 자랑하고 솔루션은 일대일 결과를 얻을 수 있지만 기성품 키트를 구입하는 것은 차이점에 대한 해결책이 아닙니다. 진지한 평가 실험과 분석 실험이 해결책입니다.
